Com Edital MCT/CNPq/PPBio Nº 60/2009 lançado em outubro de 2009 com o objetivo de fortalecer o Programa de Pesquisa em Biodiversidade – PPBio, foram aprovadas novos Núcleos Regionais, sendo que agora o PPBio Amazônia Ocidental abrange uma rede de oito projetos de pesquisa e seis instituições (INPA, UFAM, UNIR, UFMT, UFRR e UFAC). Um novo Núcleo Regional em São Gabriel da Cachoeira (AM) também deve ser criado em breve.

Projetos aprovados:
 
Núcleo Regional Acre
Responsável: Marcos Silveira
 
Responsável: Ana Claudia Kaminski 
Instituição Participante:Universidade Federal do Amazonas – Instituto de Saúde e Biotecnologia de Coari, UFAM ISB/Coari
 
Responsável: Marcelo Menin 
 
Proponente: Angelo Gilberto Manzatto 
Instituições Participantes:Universidade Federal de Rondônia (Unir)
Faculdade São Lucas de Porto Velho (FSL/PVH)
 
Núcleo Regional Roraima
Responsável: Marcos Vital
 
Núcleo Regional Sinop
Responsável: Domingos Rodrigues
 
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Novos Núcleos Regionais