A partir de Manaus, pode-se viajar por de lancha ou barco pelo Rio Negro até Novo Airão. Em Novo Airão, deve-se alugar outro barco e seguir pelo Rio Jaú até a área do Parque. Por via terrestre saindo de Manaus deve-se ir pela AM-072 Manaus/Manacapuru e Manacapuru/Novo Airão pela AM-352.
Após vários anos de pesquisa nos pequenos igarapés da Reserva Ducke, pesquisadores do Projeto Igarapés e do PPBio passaram a se perguntar se a própria pesquisa poderia trazer impactos à fauna dos peixes naqueles locais.